Otto Brändli verbrachte seine Jugend in Bauma im Tösstal/Schweiz. Unter dem Eindruck der Tuberkulosekrankheit seines Vaters wechselte er vom Mathematikstudium an der ETH Zürich zur Medizin. Er studierte in Zürich, Wien und Montpellier und war 1973-75 Fellow am Bellevue Hospital New York. Als Chefarzt wirkte er 1977-2007 in der Zürcher Höhenklinik in Wald. Er war 25 Jahre Präsident der Lungenliga Zürich und ist heute Präsident der Schweizerischen Lungenstiftung.